MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloferax mediterranei ATCC 33500 plasmid pHM300

Total Repeats: 6387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017943	GAC	2	6	10	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
2	NC_017943	GGT	2	6	25	30	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848588
3	NC_017943	GTCG	2	8	118	125	0 %	25 %	50 %	25 %	389848588
4	NC_017943	TGA	2	6	126	131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848588
5	NC_017943	GAGC	2	8	246	253	25 %	0 %	50 %	25 %	389848588
6	NC_017943	AC	3	6	321	326	50 %	0 %	0 %	50 %	389848588
7	NC_017943	GTCA	2	8	333	340	25 %	25 %	25 %	25 %	389848588
8	NC_017943	CTCGC	2	10	349	358	0 %	20 %	20 %	60 %	389848588
9	NC_017943	CAA	2	6	363	368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848588
10	NC_017943	TAC	2	6	421	426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848588
11	NC_017943	CGA	2	6	480	485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
12	NC_017943	CGA	3	9	501	509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
13	NC_017943	TCC	2	6	512	517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848588
14	NC_017943	CG	3	6	527	532	0 %	0 %	50 %	50 %	389848588
15	NC_017943	TCG	2	6	551	556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848588
16	NC_017943	ATC	2	6	571	576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848588
17	NC_017943	ACG	2	6	641	646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
18	NC_017943	ACG	2	6	665	670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
19	NC_017943	CGA	2	6	732	737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
20	NC_017943	GC	3	6	755	760	0 %	0 %	50 %	50 %	389848588
21	NC_017943	GCA	2	6	763	768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
22	NC_017943	TCC	2	6	803	808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848588
23	NC_017943	CGA	2	6	855	860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
24	NC_017943	AGC	2	6	870	875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
25	NC_017943	GAAA	2	8	876	883	75 %	0 %	25 %	0 %	389848588
26	NC_017943	CTC	2	6	910	915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848588
27	NC_017943	CTCG	2	8	951	958	0 %	25 %	25 %	50 %	389848588
28	NC_017943	TCC	2	6	959	964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848588
29	NC_017943	GGC	2	6	970	975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848588
30	NC_017943	ACG	2	6	994	999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848588
31	NC_017943	GCG	2	6	1062	1067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848588
32	NC_017943	CTC	2	6	1078	1083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848588
33	NC_017943	CTT	2	6	1165	1170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848588
34	NC_017943	TGAG	2	8	1227	1234	25 %	25 %	50 %	0 %	389848588
35	NC_017943	ATT	2	6	1814	1819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389848589
36	NC_017943	CAA	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848589
37	NC_017943	GAT	2	6	1868	1873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848589
38	NC_017943	GCG	2	6	1891	1896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848589
39	NC_017943	TTC	2	6	1921	1926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848589
40	NC_017943	TCG	2	6	2029	2034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848589
41	NC_017943	TCG	2	6	2071	2076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848589
42	NC_017943	CTT	2	6	2087	2092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848589
43	NC_017943	TC	3	6	2135	2140	0 %	50 %	0 %	50 %	389848589
44	NC_017943	GCG	2	6	2167	2172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848589
45	NC_017943	GTC	2	6	2190	2195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848589
46	NC_017943	GAT	2	6	2222	2227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848590
47	NC_017943	TCG	2	6	2238	2243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848590
48	NC_017943	GTC	3	9	2348	2356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848590
49	NC_017943	GAA	2	6	2381	2386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389848590
50	NC_017943	CGATG	2	10	2420	2429	20 %	20 %	40 %	20 %	389848590
51	NC_017943	TTTGG	2	10	2430	2439	0 %	60 %	40 %	0 %	389848590
52	NC_017943	GTC	2	6	2458	2463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848590
53	NC_017943	GTCG	3	12	2466	2477	0 %	25 %	50 %	25 %	389848590
54	NC_017943	GGTC	2	8	2497	2504	0 %	25 %	50 %	25 %	389848590
55	NC_017943	GAC	2	6	2507	2512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848590
56	NC_017943	GCA	2	6	2664	2669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848590
57	NC_017943	ACG	3	9	2679	2687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848590
58	NC_017943	GC	3	6	2735	2740	0 %	0 %	50 %	50 %	389848590
59	NC_017943	CAT	2	6	2747	2752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848590
60	NC_017943	GAG	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848590
61	NC_017943	CTC	2	6	2900	2905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848590
62	NC_017943	CGA	2	6	2950	2955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848590
63	NC_017943	GTC	2	6	3006	3011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848590
64	NC_017943	AGAC	2	8	3036	3043	50 %	0 %	25 %	25 %	389848590
65	NC_017943	ACTG	2	8	3044	3051	25 %	25 %	25 %	25 %	389848590
66	NC_017943	TGG	2	6	3061	3066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848590
67	NC_017943	CGC	2	6	3836	3841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848591
68	NC_017943	AGTC	2	8	3899	3906	25 %	25 %	25 %	25 %	389848591
69	NC_017943	CGT	2	6	3928	3933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848591
70	NC_017943	GGC	2	6	4076	4081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848591
71	NC_017943	CGG	2	6	4159	4164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848591
72	NC_017943	CGA	2	6	4174	4179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848591
73	NC_017943	TGA	2	6	4198	4203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848591
74	NC_017943	GAC	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848591
75	NC_017943	CGA	2	6	4327	4332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848591
76	NC_017943	CCG	2	6	4369	4374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848591
77	NC_017943	GGT	2	6	4380	4385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389848591
78	NC_017943	CGT	2	6	4402	4407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848591
79	NC_017943	GAG	2	6	4493	4498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389848591
80	NC_017943	TCG	2	6	4709	4714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
81	NC_017943	CGG	2	6	4773	4778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848592
82	NC_017943	TCA	2	6	4796	4801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848592
83	NC_017943	TTC	2	6	4816	4821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848592
84	NC_017943	CGA	2	6	4848	4853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848592
85	NC_017943	CGG	2	6	4872	4877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848592
86	NC_017943	CTT	2	6	4881	4886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848592
87	NC_017943	CGC	4	12	4905	4916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848592
88	NC_017943	TCG	2	6	4937	4942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
89	NC_017943	CGT	4	12	5010	5021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
90	NC_017943	CGA	2	6	5067	5072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848592
91	NC_017943	CGT	2	6	5139	5144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
92	NC_017943	GCG	2	6	5187	5192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848592
93	NC_017943	CGG	2	6	5229	5234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848592
94	NC_017943	TCG	2	6	5237	5242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
95	NC_017943	CGA	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848592
96	NC_017943	CTG	2	6	5311	5316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
97	NC_017943	GTCA	2	8	5397	5404	25 %	25 %	25 %	25 %	389848592
98	NC_017943	GTC	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
99	NC_017943	CT	3	6	5434	5439	0 %	50 %	0 %	50 %	389848592
100	NC_017943	CTC	2	6	5461	5466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848592
101	NC_017943	GTC	2	6	5467	5472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
102	NC_017943	AAC	2	6	5555	5560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389848592
103	NC_017943	CGT	2	6	5601	5606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
104	NC_017943	GAC	2	6	5616	5621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848592
105	NC_017943	GGACCG	2	12	5657	5668	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	389848592
106	NC_017943	TG	3	6	5732	5737	0 %	50 %	50 %	0 %	389848592
107	NC_017943	ATC	2	6	5756	5761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848592
108	NC_017943	TCG	2	6	5768	5773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
109	NC_017943	GTTG	2	8	5787	5794	0 %	50 %	50 %	0 %	389848592
110	NC_017943	CCCGG	2	10	5797	5806	0 %	0 %	40 %	60 %	389848592
111	NC_017943	TCG	3	9	5819	5827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
112	NC_017943	ACC	2	6	5852	5857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848592
113	NC_017943	GCA	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848592
114	NC_017943	TTC	2	6	5932	5937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848592
115	NC_017943	ACG	3	9	5948	5956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848592
116	NC_017943	ACG	3	9	5980	5988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848592
117	NC_017943	CGGA	2	8	5990	5997	25 %	0 %	50 %	25 %	389848592
118	NC_017943	TTC	2	6	6038	6043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389848592
119	NC_017943	CGAC	2	8	6059	6066	25 %	0 %	25 %	50 %	389848592
120	NC_017943	GAC	3	9	6064	6072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848592
121	NC_017943	CGG	2	6	6089	6094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389848592
122	NC_017943	TTCGA	2	10	6105	6114	20 %	40 %	20 %	20 %	389848592
123	NC_017943	ACC	2	6	6116	6121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848592
124	NC_017943	TGA	2	6	6126	6131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389848592
125	NC_017943	CGT	3	9	6135	6143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848592
126	NC_017943	GCA	2	6	6174	6179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848592
127	NC_017943	TCA	2	6	6191	6196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389848592
128	NC_017943	CGGT	2	8	6200	6207	0 %	25 %	50 %	25 %	389848592
129	NC_017943	GCC	2	6	6208	6213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389848592
130	NC_017943	C	6	6	6483	6488	0 %	0 %	0 %	100 %	389848593
131	NC_017943	CTC	2	6	6509	6514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848593
132	NC_017943	CTC	2	6	6536	6541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848593
133	NC_017943	CTC	2	6	6563	6568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389848593
134	NC_017943	ACC	2	6	6600	6605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389848593
135	NC_017943	ACG	2	6	6840	6845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848593
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140	NC_017943	ACG	2	6	7110	7115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848594
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159	NC_017943	ACTCAA	2	12	8632	8643	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	389848596
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166	NC_017943	CGA	2	6	8911	8916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848596
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253	NC_017943	CTCCA	2	10	13509	13518	20 %	20 %	0 %	60 %	389848600
254	NC_017943	CGT	2	6	13525	13530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389848600
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258	NC_017943	ACG	2	6	13664	13669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389848600
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260	NC_017943	GTT	2	6	13750	13755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389848600
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387	NC_017943	GGTC	2	8	19767	19774	0 %	25 %	50 %	25 %	389848605
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